본 발명은 음식물 처리기의 자동 살균 방법을 공개한다. 이 방법은 (a) 살균 제어 회로부가 동작 전압을 인가받아 구동함으로써 살균 모듈이 원수를 전기 분해하는 단계; (b) 상기 전기 분해된 원수가 살균수 저장부에 살균수로 저장되는 단계; (c) 부스트 펌프가 상기 살균수를 건조로로 펌핑하여 기공급되어 있는 원수와 혼합하는 단계; 및 (d) 분쇄 모터가 복수회 작동하여 상기 혼합된 살균수 및 원수가 상기 건조로를 살균하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 한다. 따라서 본 발명에 의할 경우, 음식물 쓰레기 처리 작업이 완료된 후 건조로 내 음식물 쓰레기 잔여물의 세척 및 살균 작업을 용이하게 할 수 있어 음식물 처리기의 청결을 유지할 수 있고, 건조로 내부에서 미생물이 증식되는 것을 방지하며, 음식물 처리기의 성능 및 수명을 향상시킬 수 있다.